L’Externat des Glacis est une association à but non lucratif qui, à ce titre, dispose de statuts et d’une assemblée générale, composée d’un minimum de 7 membres. L’association est responsable de la gestion de l’école, mais ne possède pas le bâtiment, propriété de l’Eglise Catholique Romaine. L’Externat des Glacis est membre de l’AGEP (Association Genevoise des Ecoles Privées) et de la FSEP (Fédération Suisse des Ecoles Privées).